Молодёжный состав «Енисея» участвовал в 2011 - 2017 годах в первенстве СФФ «Сибирь» III дивизиона в высшей и первой лигах (ранее, в 1994, 2005, 2006 годах в Кубке России среди ЛФК принимал участие «Металлург»-2).

Победитель (2013), серебряный (2011 - 2012, 2012 - 2013 гг.) и бронзовый (2014, 2015 гг.) призёр первой лиги первенства СФФ «Сибирь», финалист кубка Красноярского края в 2015, 2016, 2017 годах.

В связи с выходом главной команды Красноярска в Премьер-лигу сезон 2018 - 2019 годов провёл в молодёжном первенстве. Там коллектив занял 10-ое место, после чего был распущен и ни в каких соревнованиях участия более не принимал. 

В январе 2020 года команда была воссоздана. Участник первенства СФФ «Сибирь» III дивизиона в сезонах 2020, 2021 и 2022 годов.

В сезоне 2021 - 2022 годов сформированная команда «Енисей-2» приняла участие во Втором дивизионе ФНЛ.

Сейчас команда принимает участие в первенстве Второй лиге и на данный момент занимает 11-ое место в группе 2А.

В минувшем первенстве «Торпедо» и «Енисей-2» провели две очные встречи.

Сначала владимирские торпедовцы 1 августа 2021 года приняли на своём поле команду «Енисей-2» из Красноярска. Сильного соперника «Торпедо» встретило боевито, однако счет так и не был открыт. Зрелищная встреча завершилась вничью - 0:0.

С «Енисеем-2» торпедовцы играли первым номером, не позволили гостям развернуть атакующую игру, а сами больше владели преимуществом. В игре у «Торпедо» проявились настойчивость, высокий прессинг, хитрые заготовки в атаке, например, неожиданные подачи в штрафную площадь низом. Видны интересные задумки при исполнении штрафных. «Енисей-2» под натиском «Торпедо» во втором тайме играл больше от обороны и старался использовать контратаки. Но в нападении не преуспел. А торпедовский гол назревал весь матч. Однако так и не созрел!  Надо учесть, что в воротах у «Енисея-2» стоял многоопытный 36-летний вратарь Сергей Чепчугов, особенно известный своими выступлениями за ЦСКА в качестве партнера Акинфеева.

30 сентября 2021 года владимирское «Торпедо» провело самый дальний выездной матч в Первенстве России с «Енисеем-2» в Красноярске. При равной игре в первом тайме, торпедовцы не сдержали атаки соперника после перерыва, и красноярцы выиграли со счетом 3:0.

И вот совершив ночной перелет торпедовцы прибыли в Красноярск. Играли под крышей в футбольном манеже. Первый тайм не предвещал крупного поражения владимирской команды. Наоборот, «Торпедо» порой доминировало на поле, осаждало штрафную хозяев, контролировало мяч.  Однако очень мало остроты черно-белые создали непосредственно у ворот соперников. 

Вратарь Артем Ковешников и в одном случае штанга спасали ворота «Торпедо» от редких ударов «Енисея-2». А в красноярской команде есть активный и часто забивающий молодой форвард Андрей Окладников. Поначалу он не попадал в цель. Но во втором тайме торпедовцы ему все-таки позволили забить в первый раз: головой после подачи со штрафного. 

И понеслось! «Енисей-2» поймал кураж. А у торпедовцев перестало получаться даже то, что было до перерыва. В итоге неудержимый Окладников отправил в торпедовские ворота еще два мяча, совершив хет-трик в матче. И у Окладникова с партнерами еще были шансы увеличить счет. Попытки торпедовцев забить хотя бы гол престижа не удались. Итог - победа «Енисея-2» со счетом 3:0.